Technicky náročné projekty si nevyberá len tak. Začínal v Lucasovej ILM, kde sa účastnil na mega hitoch INDIANA JONES a HVIEZDNE VOJNY. K réžii pričuchol koncom 80. rokov trikovou rodinnou komédiou s popletenou hlavou rodiny Rickom Moranisom (otravný sused S. Weaverovej z KROTITEĽOV DUCHOV), neuznávaného vedca, ktorý v podkroví svojho domu vyrobí prístroj, ktorí mu omylom zmenší deti tak, že sa pre nich trávnik pred domom stáva smrteľne nebezpečnou džungľou. MILÁČIK, ZMENŠIL SOM DETI zabodoval natoľko, až sa dočkal niekoľkých pokračovaní, vrátane TV seriálu.
Krátko nato Johnston zabodoval úspešným rodinným dobrodružstvom JUMANJI, kde Robin Williams a Kirsten Dunstová musia kvôli démonickej hre v mestečku zlikvidovať rozbesnené stáda divokých zverov, mäsožravé obrovské rastliny, psychopatického poľovníka, zmagorené opice a čo ja viem čo ešte. Aj tento kúsok, pripomínajúci počítačovú hru, bol postavený na trikoch, ktorým ustúpil scenár aj herci, ale zábava to bola divoká, to sa musí nechať.
Na prelome milénií zaskočil netrikovou drámou s Jakeom Gillenhaalom, Chrisom Cooperom a Laurou Dernovou, OKTÓBROVÉ NEBO, ale dieru do sveta ňou neurobil, čo platí aj o pár epizódach DOBRODRUŽSTVÁ MLADÉHO INDIANA JONESA.
K tomu, čo vie najlepšie, sa vrátil v zatiaľ najväčšom úspechu svojej režijnej kariéry, dravým JURSKÝM PARKOM 3, ktorý Spielberg už len produkoval. Do deja sa vracia montanský paleontológ Sam Neill, v úvode sa mihne Dernová, dinosaury revú, ľudia kričia a sú nimi požieraní, scenár nikde, zato tempo a triky zase na slušnej úrovni.