Shinichirô Watanabe vstoupil na anime scénu vysoce ceněným pokračováním legendární série Macross, video titulem Macross Plus (1994). V roce 1998 mu byla svěřena režie televizního seriálu Cowboy Bebop, který se záhy stal kultovní záležitostí. Na seriál navázal neméně úspěšným celovečerním filmem, v Čechách vydaným jako Lovec odměn (2001), kde opět využil své charakteristické míchání žánrů a stylů. Pro bratry Wachovské (série Matrix) režíroval dva příspěvky do DVD projektu Animatrix: A Detective Story a Kid’s Story.