Johny Lee Miller se narodil 15. Listopadu 1972 do herecké rodiny. Nedokončil střední školu aby se mohl věnovat herectví.
Johny je spoluzakladatelem výrobní společnosti "Natural Nylon", kterou spoluvlastní s herci Ewanem McGregorem, Sadií Frost, Judem Lawem a Seanem Pertweem. Zajímavostí také je, že byl v letech 1995 až 1999 manželem Angeliny Jolie.