Michael Ballhaus se narodil 5. srpna 1935 v Berlíně do rodiny herců Leny Hutterové a Oskara Ballhause. Michaelova teta byla manželkou režiséra Maxe Ophülse, který značně ovlivnil Michaelovu kariéru. Ophüls jej obsadil do filmu LOLA MONTES (1955) a Michael měl možnost sledovat kameramana Christiana Matrase, což ho velmi inspirovalo.
Začátkem osmdesátých let začal pracovat i v americké produkci a po přesunu do Hollywoodu se začal podílet na mnoha kultovních snímcích. Spolupracoval s mnoha významnými režiséry jako jsou Barry Levinson (snímek SPÁČI, 1996), Francis Ford Coppola (DRACULA, 1992), Wolfgang Petersen (SMRTÍCÍ EPIDEMIE, 1995 a AIR FORCE ONE, 1997).
Nejvýznamnější tvorba Michaela Ballhause vznikla spoluprací s režisérem Martinem Scorsesem, se kterým natočil například filmy BARVA PENĚZ (1996), MAFIÁNI (1990), GANGY NEW YORKU (2002) a SKRYTÁ IDENTITA (2006).
Michael Ballhaus byl třikrát nominován na Oscara, za filmy GANGY NEW YORKU, BÁJEČNÍ BAKEROVI HOŠI a VYSÍLÁME ZPRÁVY. Nominace získal i na ceny BAFTA za VĚK NEVINNOSTI a MAFIÁNI. Od roku 1987 je členem Americké kameramanské asociace (ASC), která mu udělila v roce 2007 jako prvnímu německému kameramanovi ocenění za celoživotní dílo.